Pengadilan Agama Marisa adalah lembaga Peradilan Tingkat Pertama yang berwenang mengadili perkara yang menjadi kewenangan Pengadilan Agama dalam tingkat pertama di wilayah hukum Kabupaten Pohuwato yang terdiri dari 13 Kecamatan : 

1. Kecamatan Paguat
2. Kecamatan Dengilo
3. Kecamatan Marisa (Ibu Kota Kabupaten)
4. Kecamatan Buntulia
5. Kecamatan Duhiadaa
6. Kecamatan Patilanggio
7. Kecamatan Randangan
8. Kecamatan Taluditi
9. Kecamatan Wonggarasi
10. Kecamatan Lemito
11. Kecamatan Popayato
12. Kecamatan Popayato Timur
13. Kecamatan Popayato Barat